胎儿畸形的原因很多，比如：遗传因素，主要是染色体异常；药物因素，特别是孕3月内服用某些药物，有致畸可能；病毒感染，比如风疹病毒、梅毒、巨细胞病毒、弓形虫等等，孕前检查一般会查TORCH；还有就是环境和食品因素，比如X线辐射。总之原因是多种多样的。