子宫内膜腺体及间质侵入子宫肌层时，称为子宫腺肌症。以往曾称内在性子宫内膜异位症，而将非子宫肌层的内膜异位症称外在性子宫内膜异位症以示区别。 治疗应视患者症状和年龄而定。若在给予吲哚美辛、萘普生或布洛芬对症治疗后症状可缓解，经过治疗痊愈，一般不会影响生育。