常见的甲状腺疾病，如甲状腺功能亢进、甲状腺功能减以清退、慢性淋巴细胞性甲状腺炎等，属于自身免疫性疾病，不仅有甲状腺功能的异常，且有免疫功能的异常，血清中含有高浓度堡局的抗甲状腺球蛋白抗体和抗微粒体抗体。这些抗体可通过胎盘，进入胎儿体内，导致新生儿甲状腺功能减退。母亲产后由于免疫功能的变化，可使甲状腺功能亢进和甲状腺功能减退的病情加重。母乳具有浓缩碘的能力，通过乳汁，如甲状腺功能减退、慢性甲状腺腺炎，会影响乳汁向婴儿提供碘，导致婴儿碘的不足，发生甲状腺功能减退，而波及唤旧稼脑组织和骨骼的发育。因此这种情况，不宜母乳喂养。