内异症的西医治疗方法有药物治疗和手术治疗。药物治疗主要是激素抑制疗法，其主要目的是创造一个低雌激素环境以达到抑制疾病的目的。治疗的症状缓解率在75％～90％之间，2年妊娠率为30.5%～64％。药物治疗以闭经为准，影响患者的内分泌功能；服药后可能会影响骨质代谢，损伤肝功能，不宜长期使用，但停药后基本...可恢复正常。手术治疗方式分为保守性手术和根治性手术。由于内异症多发于育龄期妇女，因此切除子宫及双侧卵巢的根治术很难为患者接受。复发率高是保守性手术难以克服的问题，据报道切除全子宫者复发率为24.1%，保留子宫则复发率高达57.1%。无论是药物还是保守性手术均有相当高的复发率。为减少复发，目前以手术切除异位灶，术后辅以药物治疗为主要方法，报道该方法术后24周复发率为20％。而且，使用药物可能造成潮热汗出、关节疼痛等更年期症状。