怀孕6周，小便时总有红褐色的东西流出可能是先兆流产，可能是孕酮比较低所致。孕酮是女性身体内重要的孕激素，它是受孕的关键，如果孕激素水平低的话会导致不孕的。建议您注意休息，避免过度劳累，使用黄体酮，继续保胎治疗，治疗一周后复查b超，查看胎儿生长发育的情况，如无好转，及时去正规医院诊治。