巧克力囊肿是一种子宫内膜异位症。子宫内膜异位症是正常位于子宫腔的内膜出现在身体的其他部位。巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，如果子宫内膜碎片随经血逆流进入盆腔，种植在卵巢或其他部位，形成异位囊肿，这种异位囊肿的子宫内膜也受到性激素影响，随月经周期反复脱落出血，形成内含陈旧性积血的囊肿，呈褐色，粘稠如...糊状，形状如同巧克力，因此称为“巧克力囊肿”。