卵巢巧克力囊肿，又称卵巢内膜异位囊肿，是妇科病中最复杂的病，是患病女性挥之不去的梦魇，它是最不易治疗的良性肿瘤。它到处粘连，四处流窜，治疗之后又很容易复发，缠绵难愈。无论是保守手术还是药物治疗，效果均不理想，而根治手术又不适合想要生小孩的女性。巧克力囊肿除了让女性在每个经期痛苦万分之外，引起的最大麻烦就是不孕。因为它会伤害到体内的组织，如果在肠胃附近，就会造成腹泻肠胃疼痛;如果是在卵巢，就会影响到卵巢、输卵管功能，造成不孕。严重的巧克力囊肿甚至从根本上颠覆女性做母亲的天职。 通常较小的囊肿不易发生破裂，由于药物治疗效果差，难以消除巧克力囊肿，当囊肿增大到3厘米以上，自发破裂的风险开始出现，并逐渐增加，它长到一定大小，自发破裂常难以避免。因此，它的确是藏在盆腔内的“炸弹”，说不定何时会发生“爆炸挡劳”。 囊肿破裂后会引起剧烈腹痛，恶心呕吐等，常须急诊处理。囊肿破裂多发生于经前期及月经期，卵巢巧克力囊肿破裂已属于妇科领域中一种新型急腹症，以往对它认识不足，常被忽视，现对其认识逐渐加深，故已引起重视。 巧克力囊肿生长过快过大。会破坏卵巢侨径功能。 巧克力囊肿破裂。会引起卵巢的坏死，继而出现卵巢功能障碍，导致卵巢不排卵。如果是双侧的，则影响更大。破坏内分泌平衡。从而干扰了卵巢激素的正常分泌和排卵，出现闭经，子宫出血，多毛和不孕等症状。 巧克力囊肿恶性病变。使基室坊大部分卵巢组织破坏，可出现卵巢功能失调、不排卵、与四周组织粘连、阻塞输卵管等情况。这些都可造成女性不孕。