既然磁场是否危害人体仍是不确知的事，怀孕期间作核磁共振究竟安不安全，谁也不能断竖怠言。大多数动物实验都没发现核磁共振对繁殖结果有不良影响。有一位研究者发现，母鼠如果暴露于MRI之下，产下的幼鼠生长较慢，而且服部畸形的机率增高。但这些老鼠的遗传因子就有发生这些缺陷的倾向，所以实验结果能否类推及人迷锈剪尚未可知。其他研究的证据显示，操作MRI的妇女发生流产的机率可能会略增，但这些都只是初步的研究结果。妇产科使用MRI的情形愈来愈普遍，目的在于评估胎位、畸形，以及怀孕期宜一他并发脂串症。