目前医学上还不能确切知晓唇腭裂的发生根源，通常由以下两大原因造成：环境因素主要是母亲怀孕早期(怀孕3个月以前)出现下述某种状况可能会导致宝宝唇腭裂：病毒感染：如孕妇上呼吸道感染、风疹等。药物作用：如服用抗癫痫药、类胆固醇、抗过敏、抗癌药物等。内分泌：精神性或损伤性的因素，如遭到强烈的精神刺激、身体外...部遭损伤等。营养因素：早孕期的呕吐，厌食，偏食等导致维生素D、叶酸、铁、钙等的缺乏。其他因素：如照射X线、吸烟、酗酒、缺氧。另外，唇腭裂有相当部分是遗传的，一般唇腭裂发生在第一胎的概率为1/600，如果第一胎是唇腭裂的在第二胎发生唇腭裂的几率为3/100。 父母双方的年龄越大，他们的孩子患先天性兔唇得几率就越大，为减小兔唇患儿的产生的机率，父母的育龄要适当的低一点。孕妇在怀孕期间不要抽烟、喝酒和用药，还要保持良好健康的心态，以免先天性患儿的产生。