肛瘘的症状很多，一般初形成的肛瘘，流脓较多，有粪臭味，色黄而稠，有时有粪便流出;有手摸能摸到条束 状的硬管，时间较久，则脓水渐少，呈间歇性流脓;可以热水坐浴、通便、理疗，局部有急性炎症可用 抗生素 。该疗法只适用于反复发作的 脓肿 初期以及 手术 前准备，但不能彻底治愈。一般彻底治愈需手术治疗。

肛瘘是不能自愈的，必须手术治疗。手术治疗原则是将瘘管全部切开，必要时将瘘管周围 瘢痕 组织同时切除，使伤口自基底向上逐渐愈合。 根据瘘管深浅、曲直，可选用挂线疗法、肛瘘切开或切除术。