引起闭经的原因极为复杂，根据控制正常月经周期的主要环节，归纳为以下四类：
子宫性闭经
指闭经的原因在于宫，常见的疾病有多次流产、刮宫过度造成的子宫内膜损伤或粘连；结核性子宫内膜炎或流产后 引起的子官内膜炎；先天性子宫发育不全或无子宫；子宫切除术后或子官腔内放疗 引起的子宫内膜破坏。
卵巢性闭经
...常见的疾病有：先天性卵巢发育不全或缺如；40岁以前已绝经的卵巢功能早衰，卵巢手术切除或因放射治疗、炎症等原因 引起的卵巢组织被破坏；分泌雄激素过多的卵巢肿瘤等。
垂体性闭经
主要有因产后大出血、休克 引起垂体前叶组织缺血坏死或炎症、放射及手术等破坏了垂体前叶的功能，原发性垂体促性腺功能低下；多种类型的垂体肿瘤。
丘脑下部性闭经
此为最常见的一种闭经，原因有多种类型，如环境改变、过度紧张、恐惧、忧虑等精神、神经因素；神经性厌食症；营养失调或某些消耗性疾病 引起的营养不良症；长期使用妇女性避孕药或避孕针或氯丙嚷、鸦片类、利血平、多巴胺等抗精神病药物 引起的药物抑制综合征；表现为闭经、持续分泌乳汁、内生殖器官萎缩的闭经泌乳综合征；表现为闭经、不孕、多毛、肥胖的多囊卵巢综合征；还有肾上腺、甲状腺、胰腺等疾病 引起的丘脑下部功能紊乱而导致的闭经。
如上所述， 引起闭经的原因极为复杂，所以一旦确定的闭经，应及时去医院就诊，常需通过多方面的了解病史，详细查体及多种辅助检查才可找到原因，也才有可能进行有效的治疗