怀孕40天白带是咖啡色不排除有先兆流产的可能性，建议应尽快到医院明确检查，可以做B超排除宫外孕的可能或做相关检查来确定，必要时进行保胎治疗。平常避免重体力劳动，不要有过激的刺激，禁止性生活，补充营养等。