母乳喂养本身就是有菌喂养过程，利于建立以双歧杆菌为主的肠道菌群，不仅对消化，更重要的是对孩子免疫系统的建立和成熟相当重要。益生菌制剂只能部分改善肠道菌群状况，不需给正常母乳喂养儿服用。现一些配方粉也添加了益生菌，希望获得母乳喂养过程相似效果，但目前下结论还为时过早。