每一次药物治疗后都会产生身体的抗药性，无论是西药还是中药。西医治疗主要通过正规的基因检测、药敏试验，口服半祸、打针、输液大量的抗菌素等，但在人体外对某种药物敏感的病原体，进入人体内就不敏感了，加上抗菌素的大量滥用，病原体已产生了很强的耐药性，久而久之，失去了原有的药效，甚至会产生一定的副作用。而中药虽然是一种复方制剂，含有很多成分，对炎症有一定消除作用，但前列腺表面有一层脂质包膜，大多数饥怠药物成分难以透过包膜进入腺体，达到有效的抑菌浓度，由于不能穿越前列腺包膜而进入前列腺腺泡中达到冶疗作用，所以治疗效果不是很理想。 前列腺炎之所以难治是由腺体的结构所决定的，外面的包膜阻碍药物的进入，常用的抗生素无法渗入前列腺组织，到达腺体内的浓度较低，达不到杀菌浓度;另外腺体内由许多互相连通的腺管腺泡组成，当尿道炎久治不愈，病原体由后尿道前列腺部进入腺体内，引起腺泡腺管发炎厉殊荒、渗出、粘连、硬结、纤维化甚至钙化。当腺体发生器质性的病变后，治愈的难度也就相当大了。细菌性的前列腺炎的治疗要点是杀灭病原体，有的患者同时感染了衣原体、支原体、金葡菌等，更增加了治疗难度。