真核生物中含有内含子，内含子（intron）是真核生物细胞DNA中的间插序列。内含子是阻断基因线性表达的序列。DNA上的内含子会被转录到前体RNA中，但RNA上的内含子会在RNA离开细胞核进行转译前被剪除。在成熟mRNA被保留下来的基究侨因部分被称为外显子。 内含子可能含有“旧码”，就是在进化过程中丧失功能的耗肆今基因部分。哺乳动物和植物的进化程度有差异，进化过程中加入的内含子数量也不一样，真务训核细胞中的线粒体或叶绿体也有自己的基因组，并且编码部分蛋白，同时含有一部分内含子，所以不能笼统地说哺乳动物的基因组比植物大，以及编码的蛋白少，这些都与具体的物种和生长条件有关。