本品毒性小。临床应用时副作用轻，串敢医一般耐受良好。有少数病例伴有胃肠道不适，头痛、思睡、乏力等。一般在48小时内可自行缓解。大剂量服用卫耀时，初期偶可见白血球减少，治后5-6个月大多恢复到治前水平。治疗囊虫症或包虫病时，可见头痛，发热皮疹，肌肉酸痛，癫痫发作蒸絮和视力障碍等。这主要系由猪囊尾蚴解体释放出异种蛋白所致。治疗旋毛虫病亦可能出现发热，肌痛，水肿加重等免疫病理反应。本病有胚胎毒和致畸作用，孕妇和2岁以内小儿忌用。