都时隔三年了不能算强奸。三年已经过了起诉期限了吧。既然是强奸，为什么当初不起诉？

只要是在刑事追究时效内（一般为十年）都可以报案追究犯罪嫌疑人刑事责任，只是时间拖得越长，越不容易取证，没有足够的证据就不追究当事人刑事责任。 如果是同事的话，应该不存在与不满十四周岁未成年人发生性关系，以当时她的年龄为准。

好像已经失去时效了。通常是2年。但是知道和应该知道自己的权益受到侵害时，除非那时，她没有成年。