你好，巧克力囊肿是俗称，其医学名称为卵巢子宫内膜样囊肿，一般认为严重的话可能会影响生育，而且最佳方式是进行手术治疗，现在这两个方面都不能忽视，输卵管阻塞也要配合医生积极治疗，如果输卵管通畅后能怀孕的话，对治疗巧克力囊肿也有好处，建议先治疗输卵管阻塞，