医院现已全面推出专家门诊预约、特需门诊预约和专科门诊预约（仅辉劳寸限部分专科，具体详见一站式自助机和微信公众平台）。目前的预约方式（专科门诊预约目前仅开放了一站式自助机和微信公众平台）有：
1.微信预约：微信号（shchildren1）
关注“上海市儿童医院”微信，绑定（复诊患者）或者注册（初诊患者），就可以在阳阳服务大厅预约专家、专科和特需门诊。
2.一站式自助机预约
如果您开通了医院一站式服务的银医通账户，那您可以在自助服务机上预约下次专家、专科和特需门诊。
3.现场预约
就诊结束后，可以直接到医院两院区门诊大厅便民服务中心预约下次专家、特需门诊。不支持当天挂号，截止预约和取消预约时间：就诊日前一天12：00前，挂号费需在现场缴纳。
4.电话预约
挂号平台：95169，7×24小时，全国范围只收取市话费，提供普通话服务；院内电话挂号：周一至周宝迷日8：00-17：00。
62474880-82116/82117（北京西路院区）；62474880-72116/72117（泸定路院区）
5.网络预约
1)登陆医院官网，点击“预约挂号”进行预约，或直接登陆医联预约平台，选择“儿童医院北京西路院区”或“儿童医院泸定路院区”进行预约。
请按预约时段提前挂号付费：预约者，可直接使用院内一站式自助机挂号付费。
号源有限，强烈建议尽早预约，特别是内分泌科、泌尿外科等暑期热门科室（最长可预约28天的号）。
为避免影响下一次的预约，预约成功后，务必按时就诊。如因故无法按时就诊，请及时取消。
2)名医汇统一预约平台：电脑预约和手机预约。
目前名医汇APP安卓版已上线，在原有挂号基础上，增加医院预约周期，放号时间等信息展示，还推出的“府哑有号提醒”及“智能抢号”等新功能。