咖啡灌肠（Coffee Enema）的方法与一般灌肠大同小异，都能清肠、排宿便，不过使用的灌肠液是咖啡。早在两千年前，欧洲的古书中已有咖啡灌肠的记载，而第一次世界大战时，缺乏麻醉剂及吗啡，咖啡灌肠因为有止痛的效果，曾被德军在开刀时用来减轻病患的痛苦。后来德国有两位医学院的教授，以老鼠进行咖啡灌肠试验，发现不仅能清肠、止痛，还有促进肝脏排毒的效果，进而奠定了咖啡灌肠的医疗背景。一九八一年，华登堡医师以科学证明咖啡含有的成分，可帮助酵素分解血液中的毒素，使得有数十年传统的咖啡灌肠法的效用重新受到肯定。日本新谷弘实医师更以其本人三十年咖啡灌肠的经验及病患的临床结果，参考上述的研究资料，著书大力提倡咖啡灌肠，在全世界造成热烈回响。 现代著名的自然疗法之父哥森医师，在以补充有机生长的新鲜蔬果为基础而发展出的排毒理论中，最推崇咖啡灌肠，他在治疗癌症病患时，提供癌症病患大量的蔬果汁，这些蔬果汁有快速排尺饥毒作用，使病人的血液里充满了大量肝脏无法及时排除的毒素，所以哥森用一天五至六次的咖啡灌肠，帮助肝脏解毒，以舒缓患者因大量毒素排到血液中所造成的昏沉感甚至头痛。哥森医师提倡北吊的代谢疗法重点就是结肠清洁。第一先清肠排毒，第二补充裕助躬完整营养，最后才能对抗疾病。