根据您的描述，进行巧克力囊肿做过手术2个半月，服用孕三稀酮，出现月经1个月来了2回的症状，应该考虑是属于月经不调的症状，应该注意观察，积极进行调理。可以考虑服用一些活血化瘀，抗菌消炎，调节月经的药物进行治疗。