新生儿疾病筛查主要是先天性甲状腺功能低下和苯丙酮尿症两项检查，一般是在婴儿出生之后72小时，在婴儿的脚底板进行抽血检查。主要用来筛查危害严重的先天性疾病，因此新生儿疾病的筛查是非常重要的。