手术切除扁桃体需要慎重考虑，一般只在频繁发作的扁桃体炎，或者扁桃体病变全面影响儿童健康或使儿童中断学业，以及影响听力或呼吸时才考虑手术治疗。有时施行扁桃体切除术是不必要的，如果诊断有怀疑就要考虑是不是其他问题。