根据您的描述，2岁幼儿宝宝肺炎咳嗽后出现支原体感染的情况，应该遵医嘱、按疗程口服阿奇霉素抗支原体治疗为妥，一般口服用药时间不少于2周，药物治疗期间定期随访复查为妥。