卵巢囊肿与多囊卵巢综合症不同，卵巢囊肿可见于炎症感染、内分泌异常等导致，囊肿属于良性病变。多囊卵巢综合症是一种内分泌及代谢异常所致的疾病，以慢性无排卵和高雄激素血症为特征的疾病，可以出现闭经、多毛、肥胖及不孕。