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肝脏囊肿除了要区分先天性、创伤性、炎症性、肿瘤性和 寄生虫 性外，还要与肝脏血管瘤、肝脓肿、肝癌等鉴别。鉴别的方法需要临床医生根据病史、症状、体征、化验和检查去综合判断。例如肝脏海绵状血管瘤增强 CT 时浅用表筛套概现瘤内有血流、或血流由周边向中央弥散，而囊肿是没有血流的。肝癌病人常有 乙肝 、乙肝病毒携带、肝硬化，化验甲胎球蛋白升高，CT增强扫描呈现血流快进快出的夕坐表现等。
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