A、由于受精卵的细胞质几乎都来自卵细胞，因此受精卵中的核遗传物质一半来自于卵细胞，一半来自于精子，而细胞质遗传物质几乎都来自卵细胞，A错误；B、精子和卵细胞都是减数分裂形成的，所含染色体数目是体细胞的一半，两者受精形成受精卵后，受精卵中染色体的数目和本物种体细胞染色体数目相同，B正确；C、同源染色体...分离发生在减数第一次分裂的后期，C正确；D、配子具有多样的原因主要是：同源染色体上非姐妹染色单体之间的交叉互换和非同源染色体的自由组合，因此染色体的自由组合不是配子多样的唯一原因，D正确．故选：A．