疱疹性咽峡炎也是由柯萨奇病毒引起的疾病，主要表现为发热咽痛，咽峡部和口腔黏膜出现灰白色的疱疹，主要出现软腭，需要压着舌头才能看到，手部、足部没有疹子。而手足口病为红色的皮疹，在手掌、足底、舌面、硬腭（严重时可出现在软腭，但较少）均可出现皮疹。