自然界中会飞的动物有：无脊椎动物中的昆虫具有翅膀，能够飞行；脊椎动物中的鸟类，前肢变成翼、身体呈流线型、双重呼吸、体表被覆羽毛、有的骨中空，有的骨愈合、直肠很短等结构特点决定了适于飞行生活；哺乳动物中的蝙蝠，虽然其生殖方式是胎生、哺乳，但其结构特点决定了是营飞行生活的．故答案为：昆虫；鸟类；蝙蝠