在发热39度是可以给宝宝打针的，但是宝宝还小，以免影响宝宝臀肌发育，最好不要给宝宝打针，宝宝在高热期间多饮水，是可以口服一些退烧药物治疗观察的，或者是化验一下血常规，针对病原菌治疗，宝宝出现高热不退时，最好输液治疗，预防高热惊厥。